太平洋上にあらわれた巨大な怪物を追って、パリ科学博物館のアロナックス教授は、アメリカの軍鑑に乗りこんだ。ところが彼を待ち受けていたのは、ネモ船長の率いるなぞの潜水艦ノーティラス号だった…。神秘的な海底世界でくりひろげられる、スリルにみちた大冒険。